29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0684 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  95.59 
 
 		 136 aa  270  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  86.36 
 
 		 132 aa  229  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  88.52 
 
 		 133 aa  227  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  91.23 
 
 		 134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  60.32 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  59.35 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  58.33 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  56.67 
 
 		 134 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  59.09 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  59.48 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  52.71 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  60.91 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  47.9 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  53.91 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  51.67 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  54.87 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  49.61 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  28.8 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  29.73 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  27.43 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  32.48 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  29.75 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  30.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  21.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  24.3 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>