More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0078 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
285 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
282 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
292 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
278 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
288 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
276 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
281 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
283 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
286 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
277 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
278 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
279 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.939147  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
283 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
282 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
280 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
283 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  35.42 
 
 
272 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
279 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  37.15 
 
 
280 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
296 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
275 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
277 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
275 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.52 
 
 
297 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
280 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
277 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.13 
 
 
280 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
294 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.04 
 
 
282 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
255 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
279 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.62 
 
 
289 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
273 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
298 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
295 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
277 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
279 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
276 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
277 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
283 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
277 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
288 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  34.62 
 
 
295 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
277 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
277 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
298 aa  158  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
284 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
284 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
276 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
298 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
288 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
281 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
277 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 
284 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065043  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
299 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
280 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
311 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
281 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
283 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
277 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.22 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
284 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
296 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
316 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
277 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
274 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
288 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
253 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
286 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
277 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>