More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2364 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  84.18 
 
 		 183 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  67.06 
 
 		 179 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  68.29 
 
 		 166 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  71.52 
 
 		 166 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 166 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  68.55 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 166 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  69.8 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  35.2 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.43 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  31.4 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  35.8 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.11 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0132  MerR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  52.31 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 137 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  45.9 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  39.47 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  31.01 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  44.29 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  34.43 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  27.92 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  32.59 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  34 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>