44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1493 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  87.88 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  64.8 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  51.76 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  51.76 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  55.8 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  50.89 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  50.59 
 
 		 283 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  50 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  38.28 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  55 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  38.89 
 
 		 589 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  45.1 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  37.93 
 
 		 184 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  38.24 
 
 		 232 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  49.48 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  40.74 
 
 		 224 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  40.94 
 
 		 220 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  41.67 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  33.13 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5713  predicted protein  41.53 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0609583  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  35.37 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  46.45 
 
 		 985 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  39.81 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 		 1131 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  39.81 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  33.56 
 
 		 1161 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  30.59 
 
 		 198 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  24.68 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  32.58 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4223  hypothetical protein  38.27 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  32.18 
 
 		 520 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  32.18 
 
 		 520 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  38.79 
 
 		 3670 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  44.23 
 
 		 170 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  44.23 
 
 		 100 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  29.17 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  33.71 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1198 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43830  vacuolar protein sorting-associated protein 35  29.34 
 
 		 1712 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.999564  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  32.26 
 
 		 621 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  35.53 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>