More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6200 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  39.78 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  36.46 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  34.03 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  34.03 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  34.88 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.9 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 408 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  37.64 
 
 		 400 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.64 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.64 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.64 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  36.63 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.38 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  42.54 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  35.04 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  33.42 
 
 		 400 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  33.95 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  33.85 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 388 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.59 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.25 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  34.35 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  34.07 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.79 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.79 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.79 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.54 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.79 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>