91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1991 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  877    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  73.92 
 
 		 448 aa  614  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  30.82 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  33.42 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  31.68 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 419 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  30.31 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  25.66 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  25.66 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 421 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  25.66 
 
 		 421 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  26.45 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  26.45 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  26.59 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  26.59 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 427 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 214 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  24 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  21.59 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  23.01 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  24.04 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.04 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.04 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.17 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.17 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  22.96 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.17 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  36.84 
 
 		 90 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  23.45 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  21.82 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  21.43 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  35.05 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  23.06 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  35.05 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  35.05 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  23.34 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  34.02 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  32.65 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  21.71 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  21.71 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  22.54 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  32.65 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  32.65 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  32.65 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  32.65 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  21.21 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  32.65 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.45 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  21.71 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0646  putative regulatory protein UhpC  22 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  21.71 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  22.42 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  21.71 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  21.71 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  30 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  30 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>