More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6852 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1825  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.86 
 
 
351 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7304  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.88 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554386  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.88 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.31 
 
 
345 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 
363 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.13 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  37.13 
 
 
353 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.13 
 
 
364 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.13 
 
 
353 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
353 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  37.13 
 
 
353 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.13 
 
 
364 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1821  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00641517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
338 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.46 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  33.43 
 
 
384 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
345 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  31.92 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
370 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.32 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.24 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.88 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.09 
 
 
348 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.76 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.44 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.7 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.19 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.19 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.19 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  27.98 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.19 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
350 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 
345 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  28.44 
 
 
345 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.4 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
351 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 
345 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  30.06 
 
 
344 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.9 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.14 
 
 
341 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
356 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  28.44 
 
 
345 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.09 
 
 
340 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
337 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
343 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.17 
 
 
349 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 
341 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
354 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00889  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
343 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.38 
 
 
338 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.64 
 
 
338 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
373 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.53 
 
 
341 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
337 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
356 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.06 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  31.16 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.94 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.82 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.21 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  28.14 
 
 
347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  26.06 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
337 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
365 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
373 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  26.67 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  26.67 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  27.91 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.49 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  30.71 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  26.67 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.88 
 
 
341 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.88 
 
 
341 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
341 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>