More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4659 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 349 aa  684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  91.07 
 
 		 352 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  87.75 
 
 		 356 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1405  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  89.91 
 
 		 352 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1338  inner-membrane translocator  63.91 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3819  monosaccharide-transporting ATPase  59.06 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  60.32 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  60.32 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  57.88 
 
 		 343 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4330  inner-membrane translocator  65.65 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  58.31 
 
 		 341 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.89 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.63 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  37.89 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3318  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  36.59 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  37.03 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  35.39 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  35.39 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  34.38 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  35.06 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.45 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.45 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.45 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.11 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  33.88 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  34.07 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.66 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  33.44 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  33.75 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.58 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.5 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  31.17 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  29.66 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  32.89 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.53 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.15 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.61 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.74 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  30.79 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.81 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.44 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  28.78 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.6 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  28.24 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  28.83 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  31.19 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.63 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.27 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  29.72 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  30.54 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  30.54 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  30.54 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>