38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4579 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  39 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  38.67 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  32.63 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  36.3 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  35.18 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  44.72 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  36.22 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7022  hypothetical protein  37.59 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.00000183112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  35.97 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  37.79 
 
 		 495 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4145  hypothetical protein  32.33 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000490948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  37.2 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  37.17 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  31.13 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  29.25 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  30.77 
 
 		 380 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  30.71 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  38.46 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  49.02 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  40.26 
 
 		 194 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2274  hypothetical protein  24.6 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  37.18 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  38.16 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  40.28 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  28.23 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  34.29 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  30.72 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  29.94 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3503  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186564  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  34.21 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  34.78 
 
 		 193 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  35.51 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  26.23 
 
 		 183 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>