More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3973 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1978  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.75 
 
 
509 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2091  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.78 
 
 
509 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242207  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3973  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
511 aa  1016    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948651  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5377  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.19 
 
 
509 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.656347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  71.57 
 
 
518 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.409651  normal  0.0189582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1638  proton-translocating NADH-quinoneoxidoreductase, chain M  70.56 
 
 
518 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6005  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.58 
 
 
509 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.55 
 
 
509 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.58 
 
 
509 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1208  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.55 
 
 
509 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0257015  normal  0.194007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  58.01 
 
 
496 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  58.22 
 
 
496 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  58.62 
 
 
496 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  58.01 
 
 
496 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  58.01 
 
 
496 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  57.81 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  57.61 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  57.61 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  57.98 
 
 
497 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  58.22 
 
 
496 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  58.42 
 
 
496 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  54.62 
 
 
488 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  55.24 
 
 
488 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2202  NADH dehydrogenase subunit M  54.41 
 
 
488 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1879  NADH dehydrogenase subunit M  54.21 
 
 
488 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493129  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  55.74 
 
 
491 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  54 
 
 
488 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.74 
 
 
491 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1513  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.65 
 
 
490 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1039  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.95 
 
 
488 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0884  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.53 
 
 
491 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  53.89 
 
 
493 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1505  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.1 
 
 
491 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.185001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  54.9 
 
 
494 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0833  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.33 
 
 
488 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2801  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.92 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0834945  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  53.73 
 
 
494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3498  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.01 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.36 
 
 
495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.77 
 
 
491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1436  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.89 
 
 
491 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.244005  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  52.95 
 
 
495 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1275  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.1 
 
 
491 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512446  normal  0.301879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  50.91 
 
 
494 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.91 
 
 
494 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.3 
 
 
491 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0995576  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.5 
 
 
507 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.1 
 
 
504 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.41 
 
 
504 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.7 
 
 
504 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2824  NADH-quinone oxidoreductase chain M  47.32 
 
 
501 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2693  NADH-quinone oxidoreductase chain M  47.32 
 
 
501 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.7 
 
 
504 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.89 
 
 
501 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  48.3 
 
 
502 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  49.19 
 
 
491 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  48.3 
 
 
501 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  48.3 
 
 
501 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1605  NADH dehydrogenase (ubiquinone), M subunit  46.32 
 
 
506 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.35 
 
 
497 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  44.75 
 
 
515 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0558  NADH-quinone oxidoreductase chain M  46.32 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  48.14 
 
 
502 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  43.84 
 
 
513 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  43.84 
 
 
513 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  44.12 
 
 
513 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  49.89 
 
 
506 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  45.98 
 
 
501 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  47.52 
 
 
503 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.95 
 
 
507 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.49 
 
 
506 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47 
 
 
505 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.26 
 
 
503 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  43.59 
 
 
510 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  46.17 
 
 
505 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  47.52 
 
 
503 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.23 
 
 
503 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.87 
 
 
506 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  45.76 
 
 
505 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  48.6 
 
 
502 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  47.11 
 
 
512 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  45.13 
 
 
502 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  44.38 
 
 
502 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  43.99 
 
 
513 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  45.76 
 
 
502 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  44.89 
 
 
514 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  44.93 
 
 
502 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  45.34 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.65 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  50 
 
 
503 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.58 
 
 
527 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.58 
 
 
527 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  42.6 
 
 
504 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>