More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1978 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2091  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  92.32 
 
 
509 aa  906    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242207  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5377  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  91.55 
 
 
509 aa  905    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.656347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3973  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.75 
 
 
511 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948651  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  65.32 
 
 
518 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.409651  normal  0.0189582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1978  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
509 aa  1002    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1638  proton-translocating NADH-quinoneoxidoreductase, chain M  64.52 
 
 
518 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6005  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  92.13 
 
 
509 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  98.82 
 
 
509 aa  991    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  92.13 
 
 
509 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1208  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  88.58 
 
 
509 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0257015  normal  0.194007 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  60.04 
 
 
496 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  60.24 
 
 
496 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  58.82 
 
 
496 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  58.62 
 
 
496 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  59.03 
 
 
496 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  58.62 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  58.01 
 
 
496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  57 
 
 
496 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  56.68 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  56.17 
 
 
488 aa  571  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  56.58 
 
 
488 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  58.52 
 
 
491 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1879  NADH dehydrogenase subunit M  55.56 
 
 
488 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493129  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2202  NADH dehydrogenase subunit M  55.56 
 
 
488 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  55.14 
 
 
488 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.91 
 
 
491 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.77 
 
 
495 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  55.17 
 
 
493 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1513  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.94 
 
 
490 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1505  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.06 
 
 
491 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.185001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3498  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.58 
 
 
491 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1436  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.08 
 
 
491 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.244005  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.79 
 
 
491 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0833  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.73 
 
 
488 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1039  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.73 
 
 
488 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0884  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.08 
 
 
491 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1275  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.88 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512446  normal  0.301879 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.73 
 
 
494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  52.73 
 
 
494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2801  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.65 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0834945  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  52.13 
 
 
494 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  53.67 
 
 
495 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.49 
 
 
491 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0995576  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  54.1 
 
 
494 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.2 
 
 
504 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50 
 
 
504 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.9 
 
 
504 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49 
 
 
501 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.8 
 
 
504 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.42 
 
 
507 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2824  NADH-quinone oxidoreductase chain M  47.69 
 
 
501 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2693  NADH-quinone oxidoreductase chain M  47.69 
 
 
501 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  47.98 
 
 
491 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  47.22 
 
 
502 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.51 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0558  NADH-quinone oxidoreductase chain M  46.4 
 
 
506 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1605  NADH dehydrogenase (ubiquinone), M subunit  46.4 
 
 
506 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  45.79 
 
 
513 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  46.98 
 
 
513 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  45.79 
 
 
513 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.22 
 
 
503 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  45.73 
 
 
512 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  44.72 
 
 
501 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.1 
 
 
497 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  45.62 
 
 
515 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  47.12 
 
 
505 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  47 
 
 
514 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.36 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  46.5 
 
 
505 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  46.91 
 
 
505 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  46.33 
 
 
502 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  44.23 
 
 
513 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  44.47 
 
 
503 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.33 
 
 
506 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  48.37 
 
 
506 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.49 
 
 
503 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  46.01 
 
 
504 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  44.47 
 
 
503 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  44.38 
 
 
503 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  42.25 
 
 
510 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  46.42 
 
 
502 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  44.17 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  43.74 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.53 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.88 
 
 
506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  43.97 
 
 
502 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  44.01 
 
 
521 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.76 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.19 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>