32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3566 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  77.97 
 
 		 177 aa  286  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4672  transcriptional regulator, MarR family  74.58 
 
 		 177 aa  283  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  31.95 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3286  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000146824  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  47.06 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 153 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.18 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.52 
 
 		 283 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>