More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1594 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
340 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  80.7 
 
 
349 aa  550  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  77.38 
 
 
345 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  77.98 
 
 
345 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  77.38 
 
 
345 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  77.38 
 
 
345 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  77.08 
 
 
345 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  77.08 
 
 
345 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  79.71 
 
 
347 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  60.61 
 
 
342 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  55.09 
 
 
341 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1451  oxidoreductase family protein  80.57 
 
 
580 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  46.75 
 
 
350 aa  309  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  44.87 
 
 
355 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  43.86 
 
 
361 aa  297  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  43.52 
 
 
366 aa  295  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  42.94 
 
 
366 aa  293  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  42.86 
 
 
355 aa  287  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.25 
 
 
350 aa  268  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.25 
 
 
349 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 
366 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  39.35 
 
 
337 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 
366 aa  260  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  35.67 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  34.99 
 
 
352 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 
337 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
337 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  31.55 
 
 
336 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.25 
 
 
335 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  36.06 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  34.03 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  30.63 
 
 
342 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  31.96 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.75 
 
 
341 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.63 
 
 
341 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  29.63 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  29.63 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.02 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 
326 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  34.14 
 
 
334 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  33.12 
 
 
316 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  29.01 
 
 
341 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  32.5 
 
 
316 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  35.52 
 
 
323 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  35.31 
 
 
330 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.9 
 
 
353 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  35.1 
 
 
328 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 
328 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  34.62 
 
 
336 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.64 
 
 
352 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.22 
 
 
328 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  34.22 
 
 
328 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  34.22 
 
 
328 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.54 
 
 
329 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.29 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.72 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
340 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
344 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 
339 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  35.59 
 
 
334 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 
330 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 
389 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 
329 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  33.83 
 
 
340 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35.31 
 
 
330 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  31.86 
 
 
340 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  31.56 
 
 
327 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  35.63 
 
 
336 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  33.04 
 
 
339 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 
338 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  32.45 
 
 
339 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  34.52 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  34.02 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  32.46 
 
 
331 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  31.75 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  30.64 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.54 
 
 
339 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.71 
 
 
334 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  29.75 
 
 
287 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.37 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  31.81 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 
330 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  32.15 
 
 
330 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.22 
 
 
330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>