40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1032 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  63.78 
 
 		 311 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  53.16 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  53.16 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  51.9 
 
 		 301 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  47.34 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  49.43 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  49.43 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  58.59 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  50.75 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  51.02 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  41.35 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  41.35 
 
 		 224 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  47.92 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  39.49 
 
 		 589 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  43.81 
 
 		 214 aa  92  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  34.82 
 
 		 184 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  34.75 
 
 		 165 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  38.84 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  36.44 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.35 
 
 		 2179 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  35.64 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.43 
 
 		 2272 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.64 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  35.94 
 
 		 2914 aa  56.6  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2449 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.51 
 
 		 1888 aa  52.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  29.36 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32.84 
 
 		 2851 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  28.87 
 
 		 1859 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  31.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  26.17 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  30.17 
 
 		 170 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  26.17 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  36.14 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  37.04 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  34.94 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  34.94 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>