More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0562 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  100 
 
 
312 aa  618  1e-176  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.28 
 
 
286 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  41.41 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  41.41 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  42.32 
 
 
289 aa  212  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.35 
 
 
289 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  42.05 
 
 
298 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  38.82 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  38.91 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.29 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  39.19 
 
 
281 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  38.78 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  37.71 
 
 
279 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  39.3 
 
 
307 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  43.14 
 
 
292 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.38 
 
 
279 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.04 
 
 
282 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  39.8 
 
 
294 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  38.51 
 
 
282 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  36.52 
 
 
303 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  39.86 
 
 
280 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  41.03 
 
 
310 aa  192  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  39.04 
 
 
298 aa  192  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  39.53 
 
 
296 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  40.4 
 
 
279 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  38.33 
 
 
294 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  37.72 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.33 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.99 
 
 
283 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.46 
 
 
323 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.09 
 
 
321 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.41 
 
 
289 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  37.25 
 
 
295 aa  188  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.63 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  40 
 
 
306 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.33 
 
 
283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  37.71 
 
 
284 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  39.36 
 
 
278 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  39.36 
 
 
278 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.88 
 
 
283 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36.99 
 
 
283 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  39.46 
 
 
302 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  40 
 
 
305 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  35.69 
 
 
282 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  35.26 
 
 
306 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  35.63 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  38.93 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  36.05 
 
 
283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  36.99 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  39.02 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.5 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  39.08 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  37.2 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  36.79 
 
 
294 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  39.6 
 
 
283 aa  182  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  34.34 
 
 
305 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  40 
 
 
297 aa  182  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  37.24 
 
 
298 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  37.24 
 
 
298 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  40.82 
 
 
285 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  38.21 
 
 
294 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  35 
 
 
331 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  35.67 
 
 
344 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.16 
 
 
299 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  37.28 
 
 
305 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2844  parB-like partition protein  38.4 
 
 
309 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  37.5 
 
 
292 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  36.36 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  38.7 
 
 
256 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  36.55 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  37.83 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.36 
 
 
272 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  35.29 
 
 
305 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  38.29 
 
 
334 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  39.02 
 
 
358 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  36.96 
 
 
303 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  39.08 
 
 
280 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  35.96 
 
 
333 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  37.09 
 
 
301 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  35.86 
 
 
303 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  34.16 
 
 
328 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  37.88 
 
 
529 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  39.1 
 
 
282 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  35.46 
 
 
324 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.05 
 
 
296 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.76 
 
 
299 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.05 
 
 
301 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  36.91 
 
 
278 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  35.62 
 
 
294 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  37.59 
 
 
295 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  40.68 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  35.69 
 
 
283 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  36.82 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  38.78 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.22 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  42.59 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  36.08 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  36.08 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  34.47 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  35.99 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>