19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0969 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  100 
 
 
446 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  28.02 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.44 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  24.45 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.72 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.31 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  29.2 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  27.78 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  27.78 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  25.37 
 
 
416 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  24.44 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.72 
 
 
436 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  26.64 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  27.15 
 
 
578 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  26.6 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  27.22 
 
 
590 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  27.54 
 
 
672 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  25.41 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  23.62 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>