36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3640 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  100 
 
 		 417 aa  839    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  31.2 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  29.82 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  30.33 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  30.62 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  50.96 
 
 		 146 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1740  hypothetical protein  36.4 
 
 		 262 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  46.08 
 
 		 678 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  49.46 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  40 
 
 		 126 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 141 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  36.27 
 
 		 131 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  39.73 
 
 		 708 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 201 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  32.69 
 
 		 181 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  32.26 
 
 		 266 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  25.99 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5472  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.99 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693793  normal  0.393619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.99 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 171 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  30.97 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.78 
 
 		 598 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2484  extracellular solute-binding protein family 3  25.88 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  31.25 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 		 277 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  27.78 
 
 		 182 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  36.05 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  27.27 
 
 		 209 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>