67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2465 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  77.6 
 
 
184 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.81 
 
 
152 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  35.14 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93033  predicted protein  37.18 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0813304  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  33.76 
 
 
494 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  37.82 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  32.92 
 
 
367 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  34.46 
 
 
358 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  37.04 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  29.8 
 
 
237 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  35.4 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  29.8 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00356  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
394 aa  58.2  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  34.51 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  37.18 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  36.11 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  37.23 
 
 
371 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  32.68 
 
 
354 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  33.11 
 
 
159 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  32.88 
 
 
353 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  32.88 
 
 
353 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  32.88 
 
 
353 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  33.8 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  31.76 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  31.76 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  31.76 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  32.43 
 
 
157 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  28 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  31.47 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  30.56 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  28 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  33.1 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  31.76 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  33.57 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  32.64 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  32.41 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  33.33 
 
 
159 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  29.86 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  27.85 
 
 
185 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  29.49 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  27.89 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38526  predicted protein  29.05 
 
 
323 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  30.07 
 
 
143 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  29.33 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  33.6 
 
 
156 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  28.06 
 
 
143 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4144  hypothetical protein  29.49 
 
 
175 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  27.56 
 
 
276 aa  45.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4170  hypothetical protein  29.49 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00792981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  27.07 
 
 
125 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  27.89 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  35.2 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  30.14 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  25 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  30.07 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  29.45 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  35.92 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  27.93 
 
 
478 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>