More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  42.9 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  42.77 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  43.54 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  42.3 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  44.38 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  38.6 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  41.32 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  40.61 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  38.12 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  32.8 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  39.38 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  32.01 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  43.98 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.06 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.74 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3524  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  23.77 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  25.96 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  25.89 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.4 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.18 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  25.82 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  25.3 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 365 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  25.3 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  27.46 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  26.18 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  25.3 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.26 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  27.62 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  32.38 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  26.63 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  24.21 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  24.21 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  26.51 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.07 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.07 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 356 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  26.2 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  28.08 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  28.08 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  28.08 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.98 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  27.46 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  27.53 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  26.65 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  27.53 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>