33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 511 aa  1051    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  48.28 
 
 		 239 aa  177  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 585 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  27.04 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.65 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 559 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  30.45 
 
 		 553 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.66 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.29 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  27.52 
 
 		 551 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 525 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 533 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0087  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 175 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000254979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 542 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>