48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 		 933 aa  1774    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 		 881 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 		 910 aa  108  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  28.6 
 
 		 926 aa  101  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  35.13 
 
 		 934 aa  98.2  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 934 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 958 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.34 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 		 998 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.88 
 
 		 829 aa  58.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.36 
 
 		 829 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  21.88 
 
 		 413 aa  54.3  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 838 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  28.34 
 
 		 891 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 848 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 849 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.66 
 
 		 439 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 		 452 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.66 
 
 		 439 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 		 422 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.76 
 
 		 439 aa  48.9  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.83 
 
 		 422 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 395 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  24.21 
 
 		 405 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.83 
 
 		 426 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 		 846 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 		 852 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 		 426 aa  47  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 		 664 aa  47  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 		 849 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.32 
 
 		 439 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.71 
 
 		 427 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 		 426 aa  46.2  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  34.06 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.8 
 
 		 411 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.84 
 
 		 424 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.83 
 
 		 426 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  28.81 
 
 		 371 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.99 
 
 		 821 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 443 aa  45.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  32.37 
 
 		 654 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.86 
 
 		 433 aa  45.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 		 801 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  31.97 
 
 		 666 aa  44.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  31.91 
 
 		 663 aa  44.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.52 
 
 		 424 aa  44.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  35.66 
 
 		 406 aa  44.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 		 811 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>