293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
571 aa  1124    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  64.03 
 
 
578 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  70.86 
 
 
581 aa  787    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  53.77 
 
 
616 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  52.97 
 
 
568 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  52.25 
 
 
581 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  52.25 
 
 
581 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  51.99 
 
 
581 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  53.05 
 
 
572 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  50.61 
 
 
569 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  54.92 
 
 
585 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  50.97 
 
 
576 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  49.83 
 
 
587 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  51.32 
 
 
567 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  49.91 
 
 
587 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  47.73 
 
 
612 aa  382  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  47.1 
 
 
573 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  53.94 
 
 
619 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  52.25 
 
 
335 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.94 
 
 
583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  31.35 
 
 
582 aa  286  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  34.85 
 
 
598 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  31.75 
 
 
583 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  31.98 
 
 
583 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  31.75 
 
 
583 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  32.09 
 
 
583 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  32.26 
 
 
583 aa  267  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  32.26 
 
 
583 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  31.75 
 
 
583 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  31.92 
 
 
583 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  31.97 
 
 
583 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  31.75 
 
 
583 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  36.74 
 
 
546 aa  259  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  35.69 
 
 
569 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  36.32 
 
 
567 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 
589 aa  243  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  36.94 
 
 
616 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  36.94 
 
 
570 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  36.94 
 
 
570 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  36.77 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  34.72 
 
 
566 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  35.53 
 
 
566 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  32.31 
 
 
588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  31.69 
 
 
577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  35.34 
 
 
569 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  35.34 
 
 
569 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  35.42 
 
 
616 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  39.64 
 
 
334 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  42.14 
 
 
333 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  35.21 
 
 
572 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  31.33 
 
 
612 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  34.52 
 
 
567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  39.82 
 
 
334 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  37.22 
 
 
560 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  38.69 
 
 
333 aa  226  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  41.27 
 
 
331 aa  226  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  35.14 
 
 
335 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  39.34 
 
 
332 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.19 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  33.98 
 
 
548 aa  223  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  32.05 
 
 
580 aa  223  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  32.45 
 
 
544 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  34.64 
 
 
567 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.58 
 
 
333 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  41.42 
 
 
333 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.12 
 
 
331 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  33.51 
 
 
539 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  37.16 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  32.82 
 
 
572 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.53 
 
 
331 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.48 
 
 
332 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.86 
 
 
329 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.46 
 
 
332 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.71 
 
 
333 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.07 
 
 
331 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.46 
 
 
354 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.2 
 
 
333 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  34.79 
 
 
544 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  40.06 
 
 
362 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  40.06 
 
 
362 aa  210  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  39.76 
 
 
333 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.25 
 
 
356 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.47 
 
 
354 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.99 
 
 
330 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.35 
 
 
333 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.13 
 
 
356 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  36.13 
 
 
356 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.13 
 
 
356 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.13 
 
 
356 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  36.13 
 
 
356 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  34.39 
 
 
544 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.31 
 
 
329 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  34.39 
 
 
544 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  39.1 
 
 
700 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  38.84 
 
 
327 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  37.61 
 
 
352 aa  207  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.5 
 
 
333 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.61 
 
 
329 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  37.2 
 
 
695 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  36.94 
 
 
694 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>