More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2712 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  97.62 
 
 		 126 aa  246  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  96.83 
 
 		 126 aa  245  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  96.03 
 
 		 126 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  96.03 
 
 		 126 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  96.03 
 
 		 126 aa  243  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  95.29 
 
 		 90 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  59.46 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  46.02 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  44.26 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  44.8 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  46.61 
 
 		 122 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  45.05 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  47.17 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  45.37 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  47.57 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  43.64 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  48.11 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  45.28 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  43.4 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  46.08 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  38.68 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  37.86 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  35.19 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  35.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.93 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.2 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 242 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  29.41 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  31 
 
 		 364 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  31.25 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  36.92 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  31.25 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 267 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>