More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6721 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  64.8 
 
 
545 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  63.22 
 
 
545 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1113    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  64.7 
 
 
545 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  64.27 
 
 
545 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  62.94 
 
 
545 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  63.49 
 
 
576 aa  617  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  62.8 
 
 
533 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  62.99 
 
 
533 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  61.87 
 
 
544 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  58.16 
 
 
545 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  56.42 
 
 
530 aa  561  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  52.54 
 
 
580 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.56 
 
 
546 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  54.89 
 
 
537 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  50 
 
 
535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  50.19 
 
 
535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  50.57 
 
 
522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  49.91 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  45.03 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  50.37 
 
 
559 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  42.78 
 
 
541 aa  333  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.09 
 
 
554 aa  333  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.11 
 
 
534 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  43.98 
 
 
536 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  42.45 
 
 
536 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  34.47 
 
 
576 aa  262  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  33.86 
 
 
578 aa  259  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  33.52 
 
 
566 aa  259  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  35.65 
 
 
541 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.82 
 
 
557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.21 
 
 
587 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  34.51 
 
 
541 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  33.88 
 
 
562 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  33.76 
 
 
541 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.09 
 
 
552 aa  249  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  34.89 
 
 
543 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  33.64 
 
 
562 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  33.69 
 
 
558 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.18 
 
 
555 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  35.96 
 
 
564 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.49 
 
 
632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.98 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.81 
 
 
619 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.63 
 
 
569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.39 
 
 
562 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.52 
 
 
556 aa  243  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.77 
 
 
554 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  32.61 
 
 
562 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.32 
 
 
619 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  31.94 
 
 
562 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  31.94 
 
 
562 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  31.94 
 
 
562 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  31.94 
 
 
562 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.46 
 
 
561 aa  243  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  32.91 
 
 
562 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  31.94 
 
 
562 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.73 
 
 
573 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.15 
 
 
562 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.25 
 
 
593 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.88 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.32 
 
 
563 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.67 
 
 
563 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  30.76 
 
 
572 aa  239  8e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.61 
 
 
588 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.15 
 
 
553 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  35.55 
 
 
605 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.05 
 
 
561 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.8 
 
 
602 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  31.34 
 
 
638 aa  236  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  34.1 
 
 
590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.49 
 
 
558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  32.2 
 
 
622 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  31.39 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.66 
 
 
618 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  34.29 
 
 
564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  33.75 
 
 
554 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  33.03 
 
 
562 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
562 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
562 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34 
 
 
556 aa  233  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  33.03 
 
 
562 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  31.38 
 
 
555 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.09 
 
 
612 aa  233  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  34.4 
 
 
587 aa  233  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  30.88 
 
 
577 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.07 
 
 
566 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.85 
 
 
564 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  32.85 
 
 
562 aa  231  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.85 
 
 
562 aa  231  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  32.85 
 
 
562 aa  231  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  32.04 
 
 
582 aa  230  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  31.38 
 
 
562 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.92 
 
 
573 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  29.09 
 
 
587 aa  229  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.54 
 
 
573 aa  229  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.77 
 
 
570 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.77 
 
 
570 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.77 
 
 
570 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.15 
 
 
627 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>