99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2836 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  100 
 
 
448 aa  895    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  73.7 
 
 
440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  54.2 
 
 
423 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  31.54 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  33.09 
 
 
417 aa  216  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  34 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
419 aa  193  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  29.76 
 
 
422 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  32.23 
 
 
428 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  30.73 
 
 
425 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  26.24 
 
 
421 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  26.24 
 
 
421 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  26.24 
 
 
421 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  26.24 
 
 
421 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  26.71 
 
 
421 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  26.24 
 
 
421 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  26.24 
 
 
421 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
425 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  28.34 
 
 
425 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  28.34 
 
 
425 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  28.61 
 
 
425 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  28.61 
 
 
425 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
425 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  28.61 
 
 
425 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
421 aa  156  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  29.01 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  27.68 
 
 
421 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  26.29 
 
 
427 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  24.76 
 
 
214 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  23.43 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  24.75 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  40.79 
 
 
103 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  22.27 
 
 
497 aa  60.1  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  22.75 
 
 
467 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  21.91 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  23.06 
 
 
459 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  23.02 
 
 
458 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  22.93 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  23.52 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  23.06 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  23.99 
 
 
451 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  22.68 
 
 
469 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  30.84 
 
 
123 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  22.35 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  22.35 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  30.85 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  31.91 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  31.52 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  22.95 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  22.35 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  31.91 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  31.91 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  20.5 
 
 
438 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  24.47 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  30.85 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.02 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.02 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  22.3 
 
 
468 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  30.85 
 
 
446 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  28.57 
 
 
450 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  28.57 
 
 
450 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  34 
 
 
445 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  24.58 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  22.3 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  29.89 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  28.16 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  20.05 
 
 
483 aa  45.1  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  21.18 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  21.18 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
485 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  21.18 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  28.16 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  21.18 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
485 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  23.77 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  27.55 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  20.48 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  28.96 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  26.55 
 
 
434 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  21.22 
 
 
450 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  19.73 
 
 
451 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  35.05 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.68 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  23.44 
 
 
456 aa  43.9  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  22.49 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  35.06 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  26.55 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  25.43 
 
 
429 aa  43.5  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  35.05 
 
 
445 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>