More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6939 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  64.83 
 
 
511 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  65.23 
 
 
511 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  64.83 
 
 
511 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  64.83 
 
 
511 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  64.89 
 
 
511 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  64.89 
 
 
511 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  69.2 
 
 
509 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  69.2 
 
 
509 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  64.69 
 
 
511 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  69.2 
 
 
509 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  69.2 
 
 
509 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  62.07 
 
 
517 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  65.03 
 
 
511 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  100 
 
 
517 aa  1065    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  63.64 
 
 
507 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  65.62 
 
 
506 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  63.64 
 
 
507 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  81.47 
 
 
540 aa  881    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  69.2 
 
 
509 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  81.66 
 
 
540 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  81.66 
 
 
540 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  62.07 
 
 
519 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  64.86 
 
 
523 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  69.2 
 
 
509 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  65.29 
 
 
511 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  62.07 
 
 
519 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  58.45 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  58.45 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  58.45 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  51.05 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  46.44 
 
 
579 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  68.24 
 
 
366 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  46.44 
 
 
579 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  46.44 
 
 
579 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  46.44 
 
 
579 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  71.33 
 
 
366 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  47 
 
 
497 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  45.89 
 
 
468 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  46.19 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  42.34 
 
 
545 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  42.16 
 
 
545 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  41.78 
 
 
545 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  41.78 
 
 
545 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  41.78 
 
 
545 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  41.78 
 
 
545 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  55.68 
 
 
435 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  41.73 
 
 
531 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  69.03 
 
 
274 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  42.5 
 
 
532 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  42.95 
 
 
508 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  41.74 
 
 
523 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  40.99 
 
 
520 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  39.15 
 
 
537 aa  343  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  68.22 
 
 
242 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  40.08 
 
 
522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  37.86 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  40.41 
 
 
556 aa  336  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  36.28 
 
 
521 aa  333  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  41.82 
 
 
491 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  35.86 
 
 
522 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  37.13 
 
 
531 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  38.83 
 
 
527 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  37.25 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>