33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4388 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1410  hypothetical protein  83.18 
 
 		 422 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4388  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 430 aa  839    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1496  MASE1 domain-containing protein  83.18 
 
 		 422 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0970  hypothetical protein  83.49 
 
 		 430 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1055  mase1  83.72 
 
 		 430 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0119  hypothetical protein  83.18 
 
 		 422 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0529  hypothetical protein  83.18 
 
 		 422 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.733006  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5790  putative integral membrane sensor protein  98.84 
 
 		 430 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5070  putative integral membrane sensor protein  98.84 
 
 		 430 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.520625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3078  putative integral membrane sensor protein  94.2 
 
 		 431 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2292  hypothetical protein  83.49 
 
 		 430 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0913  putative PAS/PAC sensor protein  54.01 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0844  putative PAS/PAC sensor protein  54.01 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0207923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0982  hypothetical protein  53.07 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0603  putative integral membrane sensor protein  50.49 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.489405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 712 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 		 832 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  21.91 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 1211 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49160  putative sensor protein  27.27 
 
 		 1120 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000588584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  23.73 
 
 		 1055 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 1211 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0227  PAS /MASE1 sensor domain-containing protein  26.01 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 819 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.91 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5143  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.52 
 
 		 643 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248831  normal  0.87155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.36 
 
 		 2279 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1193  diguanylate cyclase  25.17 
 
 		 650 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 745 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  22.37 
 
 		 746 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 		 1342 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.87 
 
 		 1560 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 920 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>