33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0970 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1410  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  824    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4388  putative PAS/PAC sensor protein  83.49 
 
 		 430 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1496  MASE1 domain-containing protein  100 
 
 		 422 aa  824    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0970  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1055  mase1  99.77 
 
 		 430 aa  840    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  824    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  824    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.733006  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5790  putative integral membrane sensor protein  84.42 
 
 		 430 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5070  putative integral membrane sensor protein  84.42 
 
 		 430 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.520625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3078  putative integral membrane sensor protein  83.99 
 
 		 431 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2292  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0913  putative PAS/PAC sensor protein  54.95 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0844  putative PAS/PAC sensor protein  54.95 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0207923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0982  hypothetical protein  53.3 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0603  putative integral membrane sensor protein  49.75 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.489405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 712 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  23.22 
 
 		 1055 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1193  diguanylate cyclase  24.58 
 
 		 650 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5143  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.18 
 
 		 643 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248831  normal  0.87155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 819 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 1211 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.92 
 
 		 594 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  29.26 
 
 		 1251 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 1211 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.96 
 
 		 1560 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49160  putative sensor protein  29.17 
 
 		 1120 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000588584 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2279 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.64 
 
 		 832 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  21.71 
 
 		 746 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 931 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 1342 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1337  MASE1 domain protein  28.02 
 
 		 532 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>