31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0982 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0982  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  835    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0913  putative PAS/PAC sensor protein  78.22 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0844  putative PAS/PAC sensor protein  78.22 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0207923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4388  putative PAS/PAC sensor protein  53.23 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3078  putative integral membrane sensor protein  52.49 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5790  putative integral membrane sensor protein  52.99 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5070  putative integral membrane sensor protein  52.99 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.520625  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1410  hypothetical protein  53.37 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1496  MASE1 domain-containing protein  53.37 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0970  hypothetical protein  53.48 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1055  mase1  53.48 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0119  hypothetical protein  53.37 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0529  hypothetical protein  53.37 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.733006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2292  hypothetical protein  53.48 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0603  putative integral membrane sensor protein  48.29 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.489405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 1211 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 		 832 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.13 
 
 		 1116 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 1122 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5143  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.29 
 
 		 643 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248831  normal  0.87155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  25 
 
 		 819 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 1714 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  22.22 
 
 		 1055 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1140 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49160  putative sensor protein  27.97 
 
 		 1120 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000588584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 745 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0227  PAS /MASE1 sensor domain-containing protein  24.24 
 
 		 462 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 1259 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 492 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>