42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0115 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  98.85 
 
 
174 aa  347  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  98.85 
 
 
174 aa  347  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  95.4 
 
 
174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  92.57 
 
 
175 aa  322  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  91.43 
 
 
180 aa  320  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  89.66 
 
 
174 aa  317  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  75.57 
 
 
176 aa  263  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  68.18 
 
 
181 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  67.05 
 
 
181 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  66.48 
 
 
181 aa  234  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  82.2 
 
 
118 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  82.2 
 
 
118 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  82.2 
 
 
118 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  82.2 
 
 
118 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  82.2 
 
 
118 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  82.2 
 
 
118 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  44.03 
 
 
172 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  37.93 
 
 
179 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  37.43 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  37.5 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  37.08 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  33.57 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  33.57 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  32.26 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  30.13 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  37.14 
 
 
125 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  32.26 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  33.33 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  31.21 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  36.13 
 
 
127 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  31.94 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  37.35 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  37.35 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  33.33 
 
 
129 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  26.32 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  29.51 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  28.69 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  28.86 
 
 
161 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  41.89 
 
 
129 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  34.94 
 
 
123 aa  40.8  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>