37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3398 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  100 
 
 
837 aa  1620    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  40.99 
 
 
808 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  29.08 
 
 
739 aa  265  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  39.66 
 
 
898 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  38.55 
 
 
584 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  28.67 
 
 
672 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  38.55 
 
 
579 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  37.2 
 
 
631 aa  100  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  35.11 
 
 
924 aa  98.6  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  34.94 
 
 
586 aa  98.2  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  35.15 
 
 
612 aa  97.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  37.89 
 
 
580 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  36.72 
 
 
576 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  36.9 
 
 
613 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  33.14 
 
 
780 aa  95.5  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  34.55 
 
 
612 aa  95.5  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  33.93 
 
 
584 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  33.67 
 
 
801 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  29 
 
 
682 aa  91.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  34.66 
 
 
586 aa  90.5  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  33.73 
 
 
643 aa  89.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  31.15 
 
 
625 aa  88.2  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  34.81 
 
 
796 aa  87.8  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  36.69 
 
 
799 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  31.11 
 
 
610 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  27.12 
 
 
586 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  36.16 
 
 
802 aa  85.1  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  30.77 
 
 
598 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  34.09 
 
 
827 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  33.33 
 
 
632 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  32.74 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  32.7 
 
 
892 aa  77.8  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  33.14 
 
 
832 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  30.1 
 
 
1392 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  25.31 
 
 
996 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  26.9 
 
 
951 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  26.51 
 
 
985 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>