27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3391 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  65.92 
 
 		 1246 aa  792    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 618 aa  1235    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  33.75 
 
 		 628 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  31.36 
 
 		 626 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  32.16 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  30.97 
 
 		 624 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  27.89 
 
 		 847 aa  226  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  31.64 
 
 		 843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1194 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  30.16 
 
 		 628 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  27.79 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  26.87 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  22.97 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  23.84 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  25.26 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  25.14 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  24.63 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  26.53 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  24.84 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  23.21 
 
 		 637 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  23.48 
 
 		 597 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  23.42 
 
 		 672 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  23.42 
 
 		 672 aa  50.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  23.42 
 
 		 672 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  26.37 
 
 		 623 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  23.65 
 
 		 601 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  26.25 
 
 		 1200 aa  45.8  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>