268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5776 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5776  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5536  pirin domain-containing protein  94.89 
 
 		 235 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4936  Pirin-like  74.89 
 
 		 235 aa  357  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3224  pirin domain-containing protein  74.89 
 
 		 235 aa  357  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.911223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  51.28 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  42.92 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  40.09 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  39.66 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  39.91 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  39.66 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  39.91 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  39.22 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  38.79 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  37.07 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  36.64 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  37.93 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  38.53 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  38.56 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  37.71 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  36.86 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  36.48 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  38.03 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  38.08 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  38.2 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  36.75 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  36.75 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  32.66 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  30.34 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  26.56 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  28.64 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  34.36 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  29.06 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  29.06 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  29.06 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  30.34 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  30.34 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  30.34 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  29.24 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  29.06 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  27.23 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  28.63 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  29.23 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  29.66 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  29.06 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  28.7 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3096  Pirin domain protein  34.3 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  28.38 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  28.38 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  28.38 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  28.63 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  28.38 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  30.15 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  25.59 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  27.8 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  32.83 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2448  pirin domain-containing protein  32.66 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  28.12 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  25.23 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  25.23 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  31.36 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2313  pirin domain-containing protein  32.66 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0520  pirin domain-containing protein  25.57 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  29.09 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  29.85 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  29.58 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  27.73 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  29.09 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  26.13 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  27.23 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10182  hypothetical protein  31.94 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  25.23 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  26.13 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  29.29 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  26.13 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  26.13 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  26.63 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  29.29 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  26.13 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  28.28 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  30.91 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  29.55 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27889  predicted protein  28.19 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.731837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  26.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  29.15 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  28.18 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>