189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3898 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  97.49 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  97.49 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  97.07 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  97.07 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  93.72 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  93.72 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  86.19 
 
 		 243 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  86.19 
 
 		 243 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  86.19 
 
 		 243 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.42 
 
 		 239 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  83.19 
 
 		 239 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 239 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  79.74 
 
 		 239 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  73.57 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.37 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 247 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 250 aa  317  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.03 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 340 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 242 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.54 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.07 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.07 
 
 		 232 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.3 
 
 		 340 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  67.53 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  63.09 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  63.2 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.6 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.7 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60 
 
 		 236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  63.6 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  59.56 
 
 		 439 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  61.37 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  55.11 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  53.48 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.74 
 
 		 243 aa  238  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  48.75 
 
 		 344 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  48.76 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  48.76 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  48.76 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  48.76 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  48.76 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  48.76 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  48.35 
 
 		 269 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.93 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  46.93 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 260 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.21 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  46.93 
 
 		 242 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  43.91 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  42.92 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  41.07 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  39.17 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.04 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  39.38 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  39.38 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  38.57 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.15 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>