67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3729 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 378 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  93.88 
 
 		 381 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  93.62 
 
 		 381 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  94.71 
 
 		 378 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  99.74 
 
 		 378 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  93.62 
 
 		 381 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  86.81 
 
 		 379 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  76.13 
 
 		 379 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  75.86 
 
 		 379 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  76.13 
 
 		 379 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  75.6 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  67.7 
 
 		 392 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  67.42 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  66.39 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  39.62 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  34.05 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  35.29 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  39 
 
 		 871 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.04 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  39.73 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  40.23 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  39.19 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  41.1 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 816 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 232 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.49 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 		 768 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  35.38 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  35.38 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 413 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 435 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>