206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1636 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 154 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  99.35 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  88.82 
 
 		 157 aa  266  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  71.71 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  68.03 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1542  hypothetical protein  79.52 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.199996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  46.05 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  46.48 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  44.37 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  44.29 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  48.53 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  44.29 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  44.29 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2711  YjgF family translation initiation inhibitor  43.84 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  46.05 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  42.65 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  45.99 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  37.75 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  44.7 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  42.25 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  44.7 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  47.89 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  43.06 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  40.67 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  38.16 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  40.76 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  39.87 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  41.18 
 
 		 409 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  42.66 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  38.67 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  38.67 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  36.31 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>