More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1577 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  100 
 
 		 360 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1558  magnesium chelatase  95.33 
 
 		 364 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  86.74 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  86.74 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4807  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  87.85 
 
 		 358 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  87.02 
 
 		 358 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1581  magnesium chelatase  83.61 
 
 		 360 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  65.18 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  68.75 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  65.92 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1940  magnesium chelatase, subunit ChII  63.55 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1956  magnesium chelatase, subunit ChII  63.55 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2101  magnesium chelatase, subunit ChII  63.3 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0275  putative magnesium-chelatase subunit  61.58 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150915  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0885  magnesium chelatase, subunit ChII  61.58 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1613  magnesium chelatase, subunit ChII  61.58 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2406  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  77.62 
 
 		 416 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5745  magnesium chelatase  59.2 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  53.89 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.59 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  53.27 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  60.73 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  59.78 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  48.42 
 
 		 594 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  53.66 
 
 		 342 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.86 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.42 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  61.09 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  58.55 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.69 
 
 		 688 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.95 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.62 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.62 
 
 		 337 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.25 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.22 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.45 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  42.17 
 
 		 614 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.84 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.83 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.13 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  47.78 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.2 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.62 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  47.4 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.58 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.96 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.48 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.57 
 
 		 373 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  47.8 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  47.65 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.65 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.5 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.17 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.65 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.2 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.2 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.31 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.57 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.5 
 
 		 386 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.5 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  44.2 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  49.65 
 
 		 653 aa  252  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.41 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  45.14 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.1 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  43.27 
 
 		 660 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  46.59 
 
 		 637 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.56 
 
 		 665 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  47.12 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  46.73 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.52 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.36 
 
 		 394 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.14 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.87 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  38.94 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.55 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.5 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.12 
 
 		 616 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.01 
 
 		 622 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.01 
 
 		 622 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.01 
 
 		 622 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  43.22 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  43.71 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  48.58 
 
 		 670 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.7 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.03 
 
 		 674 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.56 
 
 		 788 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  42.49 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  41.05 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.02 
 
 		 674 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.24 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.06 
 
 		 341 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  46.82 
 
 		 689 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.24 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  41.61 
 
 		 347 aa  236  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.75 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  49.67 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  49.67 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  46.34 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  48.75 
 
 		 650 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>