288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2010 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0226  putative peptide synthetase  97.1 
 
 
565 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480984  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1123  peptide synthetase, putative  97.36 
 
 
415 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0626425  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2146  syringopeptin synthetase C  97.33 
 
 
636 aa  1151    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00315246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1990  syringopeptin synthetase C  97.63 
 
 
634 aa  1162    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1566  putative peptide synthetase  97.71 
 
 
478 aa  876    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000329266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2010  putative non-ribosomal peptide synthase  100 
 
 
625 aa  1224    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1122  hypothetical protein  91.08 
 
 
205 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0543248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.79 
 
 
13537 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  40.7 
 
 
6006 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  40.7 
 
 
6072 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  40.7 
 
 
6081 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  40.7 
 
 
3328 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  40.7 
 
 
3352 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  36.95 
 
 
5929 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  37.87 
 
 
5926 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  35.56 
 
 
4882 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.35 
 
 
1345 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 
7712 aa  134  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.19 
 
 
5953 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  26.37 
 
 
2664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  26.11 
 
 
3824 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  31.15 
 
 
4265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  31.33 
 
 
4265 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.33 
 
 
4239 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  28.8 
 
 
4186 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 
991 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  27.59 
 
 
3498 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.25 
 
 
1336 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  27.03 
 
 
888 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.43 
 
 
6661 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  28.13 
 
 
2093 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
897 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  26.97 
 
 
1302 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  28.53 
 
 
1314 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  27.22 
 
 
2867 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  25.57 
 
 
2883 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  27.95 
 
 
1356 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.29 
 
 
9498 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  32 
 
 
1021 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  28.35 
 
 
3786 aa  98.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  23.42 
 
 
2462 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  25.13 
 
 
1436 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  24.74 
 
 
1331 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  26.79 
 
 
1363 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1434  amino acid adenylation domain protein  27.85 
 
 
877 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 
3176 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
937 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.09 
 
 
2385 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  28.7 
 
 
1334 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.22 
 
 
2385 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  30.42 
 
 
6403 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1011  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
1976 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298916  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.09 
 
 
2385 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.09 
 
 
2385 aa  90.9  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.09 
 
 
2385 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.09 
 
 
2385 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.09 
 
 
2385 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  23.8 
 
 
5596 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  32.13 
 
 
2845 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  28.81 
 
 
2386 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1573  thioesterase  24.6 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  31.01 
 
 
4607 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.65 
 
 
2385 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.19 
 
 
2352 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.2 
 
 
2385 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  26.82 
 
 
2150 aa  87  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  33.83 
 
 
1370 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  28.33 
 
 
2365 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  28.22 
 
 
2875 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  27.88 
 
 
2386 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.55 
 
 
3331 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 
8211 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
950 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  35.58 
 
 
4468 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.04 
 
 
8646 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  35.58 
 
 
4572 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  38.1 
 
 
4383 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  29.55 
 
 
1344 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  29.26 
 
 
4489 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  29.06 
 
 
2274 aa  80.9  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  27.64 
 
 
3942 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  29.07 
 
 
3650 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  29.57 
 
 
1056 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  21.33 
 
 
1439 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.73 
 
 
5422 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  24.79 
 
 
1317 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  28.51 
 
 
2316 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  26.02 
 
 
1336 aa  78.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 
866 aa  78.2  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.25 
 
 
6176 aa  77.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_003296  RS03122  putative peptide synthase protein  29.13 
 
 
937 aa  77.4  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  27.7 
 
 
4531 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0365  thioesterase  40.54 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.387154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  32.51 
 
 
1369 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.86 
 
 
6676 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.44 
 
 
3291 aa  75.5  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  29.69 
 
 
5467 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  23.16 
 
 
4968 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 
1704 aa  74.7  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
1297 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>