More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1178 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 937 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 950 aa  1894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  43.49 
 
 		 897 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 1297 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  37.51 
 
 		 866 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 		 634 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.811397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  26.05 
 
 		 888 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  27.61 
 
 		 1345 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.72 
 
 		 1336 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.82 
 
 		 1334 aa  292  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  31.53 
 
 		 1305 aa  292  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.83 
 
 		 3291 aa  291  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 		 7712 aa  290  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  33.12 
 
 		 1315 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.54 
 
 		 6661 aa  284  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  29.46 
 
 		 4196 aa  276  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.83 
 
 		 1336 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.93 
 
 		 6676 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.96 
 
 		 2385 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  25.66 
 
 		 2151 aa  273  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  25.66 
 
 		 1331 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.18 
 
 		 2385 aa  271  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.85 
 
 		 2385 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  30.75 
 
 		 1344 aa  270  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  29.91 
 
 		 2365 aa  270  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.07 
 
 		 2385 aa  269  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  27.38 
 
 		 2386 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0365  thioesterase  43.43 
 
 		 361 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.387154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  30.63 
 
 		 1363 aa  267  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1439 aa  265  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.48 
 
 		 4531 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  27.43 
 
 		 2385 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  25.25 
 
 		 1436 aa  264  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.48 
 
 		 2386 aa  262  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  28.73 
 
 		 2274 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.03 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.12 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  26.95 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.12 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.91 
 
 		 2883 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 		 7785 aa  257  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.11 
 
 		 4489 aa  254  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1213  peptide synthetase-like protein  30.1 
 
 		 1320 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  31.16 
 
 		 5953 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  29.08 
 
 		 3942 aa  248  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  30.96 
 
 		 1345 aa  247  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.02 
 
 		 8211 aa  247  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.31 
 
 		 1160 aa  244  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  32.05 
 
 		 1525 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  31.04 
 
 		 1346 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.21 
 
 		 13537 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.83 
 
 		 8914 aa  241  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  28.29 
 
 		 4037 aa  241  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  30.82 
 
 		 2403 aa  240  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  28.12 
 
 		 6403 aa  240  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.54 
 
 		 1833 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  28.39 
 
 		 1816 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  29.43 
 
 		 1383 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  29.06 
 
 		 1405 aa  239  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1675  CtaG  30.36 
 
 		 1353 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  24.89 
 
 		 5596 aa  238  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  28.09 
 
 		 1314 aa  237  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  32.05 
 
 		 3328 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  32.05 
 
 		 3352 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  28.65 
 
 		 2845 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.05 
 
 		 6006 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.86 
 
 		 3432 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.05 
 
 		 6072 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.05 
 
 		 6081 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  29.89 
 
 		 1375 aa  234  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  31.74 
 
 		 1304 aa  233  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29.19 
 
 		 4882 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  28.6 
 
 		 1356 aa  232  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  30.03 
 
 		 1325 aa  233  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  28.97 
 
 		 3524 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0995  amino acid adenylation domain-containing protein  25.76 
 
 		 1284 aa  231  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.966277  hitchhiker  0.000000137922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.24 
 
 		 1317 aa  230  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  27.96 
 
 		 3470 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  28.65 
 
 		 2875 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  31.55 
 
 		 3761 aa  227  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  31.07 
 
 		 4520 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  29.97 
 
 		 2877 aa  226  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  28.74 
 
 		 2878 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.55 
 
 		 5926 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  27.93 
 
 		 3111 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  25.51 
 
 		 4968 aa  224  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  29.51 
 
 		 3532 aa  223  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1638  peptide synthetase-domain-containing protein  31.11 
 
 		 612 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1415  peptide synthetase-domain-containing protein  31.11 
 
 		 612 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  30.13 
 
 		 1296 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2140  peptide synthetase-domain-containing protein  31.11 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3173  peptide synthetase-domain-containing protein  31.11 
 
 		 612 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  25.51 
 
 		 1922 aa  222  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2525  amino acid adenylation domain-containing protein  31.11 
 
 		 633 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  31.11 
 
 		 612 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  25.19 
 
 		 4960 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2667  peptide synthetase-domain-containing protein  31.11 
 
 		 630 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  31.53 
 
 		 2412 aa  220  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.88 
 
 		 2448 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  26.1 
 
 		 3453 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>