More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3137 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 866 aa  1691    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 897 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 937 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 950 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 1297 aa  354  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  29.85 
 
 		 888 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1439 aa  285  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.93 
 
 		 6676 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.54 
 
 		 1336 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.72 
 
 		 1363 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 634 aa  275  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.811397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.76 
 
 		 1331 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 		 6661 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.09 
 
 		 5953 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  32.82 
 
 		 1305 aa  271  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.09 
 
 		 4531 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  31.94 
 
 		 2365 aa  267  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.14 
 
 		 2386 aa  262  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.93 
 
 		 1345 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.44 
 
 		 1334 aa  259  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31 
 
 		 2385 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.61 
 
 		 2386 aa  259  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31 
 
 		 2385 aa  258  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.22 
 
 		 2385 aa  257  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.53 
 
 		 2385 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.45 
 
 		 5596 aa  255  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.53 
 
 		 2385 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.58 
 
 		 2385 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.49 
 
 		 2385 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.09 
 
 		 3942 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32.83 
 
 		 7712 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.21 
 
 		 2385 aa  250  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.21 
 
 		 2385 aa  250  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  34.75 
 
 		 1344 aa  247  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  32.99 
 
 		 1405 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  31.44 
 
 		 4489 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.71 
 
 		 1336 aa  239  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1638  peptide synthetase-domain-containing protein  35.67 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1415  peptide synthetase-domain-containing protein  35.67 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1213  peptide synthetase-like protein  32.24 
 
 		 1320 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313866  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.96 
 
 		 4968 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2140  peptide synthetase-domain-containing protein  35.67 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3173  peptide synthetase-domain-containing protein  35.67 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2525  amino acid adenylation domain-containing protein  35.67 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  35.67 
 
 		 612 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2667  peptide synthetase-domain-containing protein  35.67 
 
 		 630 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.84 
 
 		 1160 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  33.24 
 
 		 3328 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 		 1356 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.79 
 
 		 2352 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.24 
 
 		 6072 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  33.24 
 
 		 6081 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  33.24 
 
 		 3352 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  33.24 
 
 		 6006 aa  234  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  30.37 
 
 		 2875 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  30.13 
 
 		 1314 aa  233  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1434  amino acid adenylation domain protein  29.65 
 
 		 877 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  27.63 
 
 		 2151 aa  233  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  29.32 
 
 		 2878 aa  231  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 		 2274 aa  230  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  32.49 
 
 		 1315 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  29.77 
 
 		 1317 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.93 
 
 		 6403 aa  227  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  30.93 
 
 		 1383 aa  227  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.93 
 
 		 8211 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.75 
 
 		 2883 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  30.23 
 
 		 2845 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  31.84 
 
 		 5926 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  31.57 
 
 		 1346 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 3453 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  32.31 
 
 		 2883 aa  226  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.76 
 
 		 1839 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  29.38 
 
 		 2877 aa  225  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.27 
 
 		 5328 aa  225  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.63 
 
 		 5469 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.45 
 
 		 13537 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.9 
 
 		 2448 aa  224  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5730  peptide synthetase  29.3 
 
 		 1327 aa  224  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.39 
 
 		 5929 aa  224  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  31.47 
 
 		 1345 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 		 1375 aa  223  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  29.9 
 
 		 1069 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.92 
 
 		 3291 aa  223  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  30.92 
 
 		 1293 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.12 
 
 		 1864 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3684  amino acid adenylation domain protein  35.9 
 
 		 2109 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  32.57 
 
 		 1304 aa  220  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  30.29 
 
 		 1293 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  30.24 
 
 		 3470 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  24.19 
 
 		 1436 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.85 
 
 		 4882 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  31.6 
 
 		 3524 aa  219  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  30.77 
 
 		 5467 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1675  CtaG  31.33 
 
 		 1353 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  30.14 
 
 		 1293 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 		 1293 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1293 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  30.92 
 
 		 1293 aa  218  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  30.14 
 
 		 1293 aa  218  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  32.03 
 
 		 7785 aa  218  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>