More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5730 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4808  amino acid adenylation domain protein  44.61 
 
 		 1329 aa  1069    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5730  peptide synthetase  100 
 
 		 1327 aa  2696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1347  amino acid adenylation domain-containing protein  43.61 
 
 		 1000 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3319  amino acid adenylation domain protein  44.81 
 
 		 1343 aa  1055    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.020024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  38.14 
 
 		 1370 aa  781    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  35.1 
 
 		 2626 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  37.45 
 
 		 4037 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  38.14 
 
 		 5654 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  34.76 
 
 		 2878 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.85 
 
 		 5230 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  37.15 
 
 		 6176 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.56 
 
 		 2189 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  38.85 
 
 		 2845 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  38.4 
 
 		 4991 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.28 
 
 		 5149 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  34.64 
 
 		 4136 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.6 
 
 		 3208 aa  489  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  31.28 
 
 		 3942 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.4 
 
 		 3470 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 		 5328 aa  475  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  36.02 
 
 		 5467 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.3 
 
 		 4317 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  37.39 
 
 		 2651 aa  473  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.27 
 
 		 4317 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.28 
 
 		 4317 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.71 
 
 		 4317 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  31 
 
 		 1801 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.21 
 
 		 4332 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  31.31 
 
 		 1138 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.96 
 
 		 1336 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.34 
 
 		 4336 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.28 
 
 		 4336 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  42.47 
 
 		 1674 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.24 
 
 		 1732 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  31.55 
 
 		 5213 aa  429  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  43.24 
 
 		 1732 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  33.74 
 
 		 1358 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  43.24 
 
 		 1739 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.24 
 
 		 1732 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  40.64 
 
 		 1663 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  43.24 
 
 		 1745 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  43.24 
 
 		 1741 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  41.5 
 
 		 1675 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  40.86 
 
 		 1662 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  40.86 
 
 		 1662 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.24 
 
 		 1732 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.12 
 
 		 3086 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2417  non-ribosomal peptide synthetase, putative  44.09 
 
 		 1772 aa  426  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.12 
 
 		 3086 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1559  amino acid adenylation domain-containing protein  40.25 
 
 		 1669 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203226  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  29.49 
 
 		 2033 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1538  amino acid adenylation domain-containing protein  40.71 
 
 		 1670 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.97 
 
 		 6661 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  31.72 
 
 		 2155 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.87 
 
 		 6676 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  31.3 
 
 		 4318 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1616  amino acid adenylation domain-containing protein  41.61 
 
 		 1665 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0177803 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.58 
 
 		 1550 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 		 1556 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1597  amino acid adenylation domain-containing protein  42.27 
 
 		 1658 aa  413  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.04 
 
 		 4342 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  29.98 
 
 		 2448 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4038  amino acid adenylation domain-containing protein  39.22 
 
 		 1659 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.21 
 
 		 4531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  27.05 
 
 		 3291 aa  409  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  26.63 
 
 		 1331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.79 
 
 		 3308 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  28.47 
 
 		 1556 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.63 
 
 		 7712 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.31 
 
 		 3498 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  30.71 
 
 		 4342 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.88 
 
 		 1839 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.21 
 
 		 3176 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.9 
 
 		 2385 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.38 
 
 		 1833 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  32.96 
 
 		 888 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  27.83 
 
 		 1786 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.9 
 
 		 2385 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.4 
 
 		 2385 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.51 
 
 		 4968 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.58 
 
 		 2385 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  30.33 
 
 		 1142 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  28.3 
 
 		 1093 aa  396  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  36.24 
 
 		 2606 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.77 
 
 		 2581 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.34 
 
 		 6403 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  30.16 
 
 		 1127 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  31.07 
 
 		 1776 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  28.43 
 
 		 1816 aa  393  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.12 
 
 		 2385 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  28.84 
 
 		 2571 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  29.52 
 
 		 2151 aa  390  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  33.33 
 
 		 1518 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.15 
 
 		 2385 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1439 aa  389  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.56 
 
 		 2385 aa  390  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.5 
 
 		 2385 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 		 1110 aa  390  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  30.9 
 
 		 1345 aa  390  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  28.84 
 
 		 2571 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>