More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3684 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.94 
 
 
3291 aa  847    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  27.63 
 
 
1922 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  30.55 
 
 
2155 aa  698    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.63 
 
 
8914 aa  822    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  31.82 
 
 
2187 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  32.52 
 
 
3470 aa  795    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  30.78 
 
 
2174 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.87 
 
 
4317 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.46 
 
 
1714 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  32.66 
 
 
2137 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.63 
 
 
5953 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.99 
 
 
6889 aa  818    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.74 
 
 
2385 aa  710    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.28 
 
 
4336 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.99 
 
 
4317 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  30.43 
 
 
2151 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  28.93 
 
 
3114 aa  693    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  34.18 
 
 
3168 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.29 
 
 
5929 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.37 
 
 
2386 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.13 
 
 
3432 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.07 
 
 
4531 aa  814    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.37 
 
 
2385 aa  725    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  28.43 
 
 
2345 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.53 
 
 
2385 aa  734    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.31 
 
 
2385 aa  714    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  34.08 
 
 
3328 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  34.06 
 
 
2125 aa  812    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2106  amino acid adenylation domain-containing protein  38.38 
 
 
1927 aa  1168    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.96 
 
 
3021 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.85 
 
 
4336 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.48 
 
 
2154 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.53 
 
 
4383 aa  777    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  34.2 
 
 
3165 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  31.98 
 
 
5926 aa  746    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.04 
 
 
9498 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.56 
 
 
5372 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  30.86 
 
 
5469 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.11 
 
 
13537 aa  795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.24 
 
 
6676 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.29 
 
 
3629 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.92 
 
 
2867 aa  1133    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.22 
 
 
2791 aa  1110    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.39 
 
 
2156 aa  810    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.82 
 
 
3308 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.13 
 
 
3498 aa  827    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  29.41 
 
 
6404 aa  743    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  32.36 
 
 
3331 aa  737    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.17 
 
 
4317 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.8 
 
 
2370 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  30.44 
 
 
6274 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.95 
 
 
6072 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  31.37 
 
 
4572 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.61 
 
 
3291 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  31.84 
 
 
5467 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.53 
 
 
4502 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  32.12 
 
 
2136 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  31.86 
 
 
5422 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.05 
 
 
4882 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.99 
 
 
3002 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  27.74 
 
 
2138 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.05 
 
 
4332 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.6 
 
 
2386 aa  720    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.4 
 
 
4342 aa  720    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.37 
 
 
2385 aa  725    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.59 
 
 
4037 aa  774    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.97 
 
 
3395 aa  680    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  31.2 
 
 
3650 aa  651    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.64 
 
 
4968 aa  840    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  35.13 
 
 
4290 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.89 
 
 
4489 aa  710    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 
3942 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  31.64 
 
 
3102 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.62 
 
 
4317 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  33.67 
 
 
8915 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  35.69 
 
 
2350 aa  941    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.77 
 
 
5596 aa  774    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.32 
 
 
6661 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  33.55 
 
 
7785 aa  755    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.82 
 
 
2820 aa  917    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.6 
 
 
3176 aa  703    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.79 
 
 
8646 aa  820    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.65 
 
 
2352 aa  739    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.57 
 
 
4342 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.64 
 
 
5149 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  30.94 
 
 
2189 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.76 
 
 
2448 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  31.91 
 
 
2201 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  32.03 
 
 
6176 aa  751    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.66 
 
 
2151 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  30.62 
 
 
3962 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.13 
 
 
4991 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.75 
 
 
5328 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  34.08 
 
 
3352 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 
5230 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  30.57 
 
 
6271 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.07 
 
 
6006 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  30.55 
 
 
6272 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.12 
 
 
6081 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  31.28 
 
 
4468 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>