47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_1817 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  588  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  100 
 
 
280 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  98.93 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  87.86 
 
 
280 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  87.86 
 
 
280 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  87.14 
 
 
280 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.12 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.57 
 
 
278 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  44.19 
 
 
278 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  44.7 
 
 
296 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  42.09 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.19 
 
 
278 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.93 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.01 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  27.06 
 
 
269 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  22.88 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.1 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  21.28 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.22 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  23.62 
 
 
843 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.05 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.87 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  17.87 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.49 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  21.66 
 
 
338 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.46 
 
 
828 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  30.61 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  23.17 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  23.28 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  23.28 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  27.1 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  18.42 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  24.84 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  24.43 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  21.4 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  20.23 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  23.13 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  20.45 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.49 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  19.33 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  22.03 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  23.17 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  19.69 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  21.8 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>