46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2003 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  99.13 
 
 		 258 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  88.26 
 
 		 230 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  68.02 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  65.29 
 
 		 222 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  65.29 
 
 		 222 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  66.26 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  58.38 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  51.79 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.2 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  43.79 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  43.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.05 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  43.2 
 
 		 317 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.56 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.99 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.11 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.11 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.58 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.18 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 		 312 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.94 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.67 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.02 
 
 		 315 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.02 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.83 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.46 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.89 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.61 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.45 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.53 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.59 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  31.98 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.79 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.98 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.41 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.84 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.32 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  26.38 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.49 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  23.53 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.28 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.79 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>