More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0966 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0966  caib/baif family protein  100 
 
 
398 aa  755    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363994  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3038  CAIB/BAIF family protein  96.35 
 
 
425 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1271  putative Acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase protein  96.35 
 
 
425 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2913  CAIB/BAIF family protein  96.35 
 
 
425 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2233  CAIB/BAIF family protein  99.03 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1719  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  86.7 
 
 
425 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473881  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3162  Citryl-CoA lyase  62.22 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.33357  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4131  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.07 
 
 
413 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1620  Formyl-CoA transferase  48 
 
 
404 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000596861  decreased coverage  0.0000000165542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1262  putative Acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase protein  44.03 
 
 
416 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3030  CAIB/BAIF family protein  44.03 
 
 
420 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2227  CAIB/BAIF family protein  47 
 
 
412 aa  169  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1100  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.19 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.44 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615075  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4083  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.15 
 
 
398 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1386  hypothetical protein  43.87 
 
 
399 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0255273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3505  Formyl-CoA transferase  48.04 
 
 
411 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1829  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.96 
 
 
413 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2222  CAIB/BAIF family protein  48.9 
 
 
401 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1358  CAIB/BAIF family protein  49.45 
 
 
401 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2202  CAIB/BAIF family protein  49.45 
 
 
401 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1120  CAIB/BAIF family protein  49.45 
 
 
401 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2358  hypothetical protein  46.96 
 
 
413 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0628874  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0049  CAIB/BAIF family protein  49.45 
 
 
401 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1848  CAIB/BAIF family protein  49.45 
 
 
401 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00504727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2240  CAIB/BAIF family protein  49.45 
 
 
401 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16130  hypothetical protein  44.5 
 
 
409 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2370  CAIB/BAIF family protein  48.9 
 
 
401 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.907744  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0872  Formyl-CoA transferase  47.16 
 
 
397 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2745  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.89 
 
 
418 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1691  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.67 
 
 
396 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0954  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.85 
 
 
421 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0829746  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1212  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.67 
 
 
396 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4144  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.02 
 
 
399 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.698652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1234  Formyl-CoA transferase  42.73 
 
 
402 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6186  Formyl-CoA transferase  47.19 
 
 
386 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101384  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6977  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.43 
 
 
397 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1651  Formyl-CoA transferase  48.57 
 
 
418 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.579204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0346  Formyl-CoA transferase  48.6 
 
 
412 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1555  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.2 
 
 
396 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0174  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  44.55 
 
 
400 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1475  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.5 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4246  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.5 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4249  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.39 
 
 
397 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0365  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.24 
 
 
396 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1449  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.56 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3782  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.31 
 
 
396 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1663  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.07 
 
 
396 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0856  Formyl-CoA transferase  45.4 
 
 
399 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1735  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.6 
 
 
401 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0615326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1080  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.02 
 
 
399 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1038  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.2 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3268  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.29 
 
 
391 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.7 
 
 
401 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3871  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.43 
 
 
397 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.39623  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2874  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.59 
 
 
405 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423527  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2108  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.05 
 
 
398 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3113  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.4 
 
 
399 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2730  acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase  46.29 
 
 
405 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743365  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5093  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.43 
 
 
397 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2359  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.41 
 
 
406 aa  150  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.433272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4852  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.86 
 
 
396 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5125  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.62 
 
 
401 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.46 
 
 
396 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3276  hypothetical protein  45.5 
 
 
400 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000379613  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.07 
 
 
426 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.949796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1590  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.5 
 
 
396 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296049  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2872  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.41 
 
 
406 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  44.5 
 
 
404 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1197  hypothetical protein  41.7 
 
 
405 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71679  normal  0.667677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3894  CAIB/BAIF family protein  45.03 
 
 
396 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0523257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.16 
 
 
429 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1599  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.16 
 
 
396 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.96 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1848  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.96 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3718  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.38 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.96 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3391  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.15 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  43.98 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1288  hypothetical protein  46.67 
 
 
409 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1033  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.09 
 
 
399 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4039  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.07 
 
 
407 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194141  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0294  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.71 
 
 
406 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316386 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  45.71 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1133  Formyl-CoA transferase  40.81 
 
 
402 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1444  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.4 
 
 
401 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141686  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1380  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.4 
 
 
401 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.260314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2997  Alpha-methylacyl-CoA racemase  44.97 
 
 
419 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.71 
 
 
407 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1041  Formyl-CoA transferase  40.81 
 
 
402 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  43.07 
 
 
398 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0909  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.6 
 
 
479 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0910  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.82 
 
 
405 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.397198  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4904  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.71 
 
 
397 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2125  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.97 
 
 
398 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3358  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.11 
 
 
396 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4175  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.02 
 
 
406 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.16 
 
 
419 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0077  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.59 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0191  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.55 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>