57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1985 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  681    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  48.97 
 
 
371 aa  347  1e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  32.54 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  33.58 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
332 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
399 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 
317 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  27.71 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.8 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.46 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.74 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  26.21 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  26.69 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 
754 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  24.43 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  26.14 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  24.03 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  25.09 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 
335 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  24.83 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 
611 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  19.4 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  22.49 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  24.21 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  22.9 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0457  hypothetical protein  28.77 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.367166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  22.9 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  22.92 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  21.54 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.21 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  21.62 
 
 
324 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  19.44 
 
 
328 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  23.76 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  20.51 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  29.9 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  26.49 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0043  hypothetical protein  27.1 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  21.58 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  22.71 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  24.82 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  19.5 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  22.85 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  23.38 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  21.54 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  19.83 
 
 
347 aa  42.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>