More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1601 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  100 
 
 
417 aa  870    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  45.1 
 
 
386 aa  358  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  42.12 
 
 
391 aa  342  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  44.25 
 
 
385 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
394 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  36.5 
 
 
381 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  35.99 
 
 
390 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  34.11 
 
 
514 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  33.94 
 
 
385 aa  222  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 
390 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  33.59 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  35.6 
 
 
383 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  33.25 
 
 
381 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  30.71 
 
 
391 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 
390 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  31.44 
 
 
396 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  34.65 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
392 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
391 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  29.16 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 
385 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 
386 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  31.7 
 
 
395 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  33.33 
 
 
407 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.15 
 
 
397 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 
415 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  31.69 
 
 
386 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  30.21 
 
 
400 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  33.75 
 
 
384 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 
383 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  29.38 
 
 
393 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  29.38 
 
 
393 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 
393 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  28.79 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  35.52 
 
 
384 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  27.73 
 
 
383 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
394 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  31.82 
 
 
393 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 
387 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  27.73 
 
 
383 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  28.68 
 
 
393 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
379 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  28.68 
 
 
392 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  27.55 
 
 
389 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  27.73 
 
 
383 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  27.73 
 
 
383 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  27.73 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  30.47 
 
 
386 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 
386 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  27.2 
 
 
383 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 
386 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
397 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  27.2 
 
 
383 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 
401 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 
372 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  27.86 
 
 
409 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  28.53 
 
 
383 aa  176  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  26.93 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
370 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  26.93 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  28.97 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  28.11 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  27.94 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  29.4 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  30.2 
 
 
385 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 
386 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 
390 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  29.97 
 
 
390 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  29.27 
 
 
386 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 
390 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  29.97 
 
 
390 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  29.97 
 
 
390 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  30.52 
 
 
390 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  29.7 
 
 
390 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 
394 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  31.7 
 
 
391 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  26.38 
 
 
397 aa  169  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  29.7 
 
 
390 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  29.7 
 
 
390 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  29.7 
 
 
390 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  29.7 
 
 
390 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  28.03 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
383 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  27.2 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 
386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  28.42 
 
 
393 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  28.15 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
412 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
399 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  28.68 
 
 
376 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  30.33 
 
 
390 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  25.89 
 
 
393 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  29.65 
 
 
390 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  26.63 
 
 
404 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.54 
 
 
390 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  27.79 
 
 
391 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>