More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0001 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0001  cold shock protein  100 
 
 		 79 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  54.93 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  50.63 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  50.7 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0290  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.93 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  55.88 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  52.11 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0521  cold-shock DNA-binding domain protein  55.71 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  53.73 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  52.17 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.52 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19390  cold-shock DNA-binding protein family  52.11 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.704539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  53.52 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.94 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  53.52 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.41 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.41 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.41 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.41 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.41 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.41 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  54.93 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.93 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  55.88 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  54.93 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  52.94 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.57 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00627672  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.7 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.7 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.613597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.7 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.41 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.7 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2701  cold-shock DNA-binding domain protein  51.47 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  51.47 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  52.94 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.93 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1135  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  50.7 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.93 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.7 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  52.11 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.88 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.29 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  51.47 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  55.88 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  50.7 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  47.83 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.3 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  47.83 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  51.47 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.11 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  50.72 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  50.72 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.94 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 66 aa  67  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  53.52 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 67 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  49.3 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.47 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  51.47 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  49.28 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>