More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2424 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2424  putative transporter-like protein  100 
 
 
288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2493  oligopeptide transport system, permease  99.31 
 
 
288 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.700486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2150  oligopeptide transport system, permease  96.18 
 
 
288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.5 
 
 
288 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2229  hypothetical protein  90.34 
 
 
207 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0499887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.64 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0896  putative ABC transporter, permease protein  50 
 
 
288 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.06594e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0854  oligopeptide transport system permease protein OppB  48.92 
 
 
279 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0892  peptide ABC transporter, permease protein  49.64 
 
 
288 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0538689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0697  oligopeptide ABC transporter, permease  48.56 
 
 
288 aa  265  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0964  putative ABC transporter, permease protein  48.92 
 
 
288 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.841152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0711  oligopeptide transport system, permease  49.45 
 
 
288 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00783408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4482  putative ABC transporter, permease protein  50.38 
 
 
288 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0368611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0762  hypothetical protein  48.83 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0801  putative ABC transporter permease  48.83 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2228  hypothetical protein  97.3 
 
 
74 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0556662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0228334  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0026  oligopeptide transport system permease  29.43 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3073  hypothetical protein  29.15 
 
 
300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.936386  normal  0.023792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
300 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0520251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2113  hypothetical protein  29.43 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.187589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2269  hypothetical protein  29.43 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2380  hypothetical protein  29.81 
 
 
300 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0707697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2052  oligopeptide transport system, permease  29.43 
 
 
300 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000157792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2050  oligopeptide transport system, permease  29.43 
 
 
300 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2295  hypothetical protein  29.43 
 
 
300 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000104504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2298  hypothetical protein  30.23 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2252  hypothetical protein  29.04 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.811282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0763  oligopeptide transport system permease, C-terminus  55.74 
 
 
62 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.373556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.6653  normal  0.747134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.69 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.670185  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.56 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.5 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.85 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.77891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.3 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06690  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  27.39 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103522  normal  0.413744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
311 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
307 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
316 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.585262  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 
311 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.78 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  24.83 
 
 
308 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1751  IM pore protein  24.52 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.36 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0789  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, innermembrane subunit  28.44 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  27.37 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.77 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08360  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  25.58 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.603278  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1272  ABC transporter, permease component  29.41 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  22.13 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4849  ABC transporter, permease  24.05 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315179  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.44 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.12 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  29.79 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.1 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
460 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.84 
 
 
314 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000749118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2771  ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.519421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.03 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  22.36 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  22.13 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003658  oligopeptide ABC transporter permease protein  26.71 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
459 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.431883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.6 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.11 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.3 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1517  peptide ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0892192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00064636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.22 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.114167  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.7 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>