More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6437 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  100 
 
 		 332 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  83.13 
 
 		 332 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  84.52 
 
 		 331 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.53 
 
 		 332 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  81.33 
 
 		 332 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  83.7 
 
 		 334 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80.8 
 
 		 322 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  83.39 
 
 		 334 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  81.44 
 
 		 334 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  83.96 
 
 		 334 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  84.39 
 
 		 329 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.81 
 
 		 333 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  76.81 
 
 		 333 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.44 
 
 		 333 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.76 
 
 		 308 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.87 
 
 		 335 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.04 
 
 		 332 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.5 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  41.01 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.68 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.65 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.32 
 
 		 392 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.06 
 
 		 372 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.19 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.76 
 
 		 365 aa  225  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.3 
 
 		 369 aa  225  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.19 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.84 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  42.05 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.59 
 
 		 284 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  39.93 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  38.4 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  38.38 
 
 		 274 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  37.83 
 
 		 276 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  39.68 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  38.97 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  40.65 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  39.33 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  35.94 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  37.55 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  40.97 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  35.79 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  38.4 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  41.13 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  38.78 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  35.56 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  36.43 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  35.93 
 
 		 293 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  38.6 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  36.07 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.47 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  38.15 
 
 		 280 aa  159  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  34.21 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  36.44 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  35.59 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  34.83 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  36.06 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  37.59 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  34.01 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  42.33 
 
 		 731 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  37.3 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  35.23 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  35.58 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  36.1 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  34.96 
 
 		 288 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  37.1 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  36.57 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  34.77 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  37.1 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  36.16 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  34.72 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  37.1 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  33.72 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  35.71 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.44 
 
 		 296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  37.45 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  37.05 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  35.45 
 
 		 275 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  35.21 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  38.32 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  37.22 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  36.69 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  38.94 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.9 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  36.47 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  36.94 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  33.81 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  36.84 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  37.17 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  36.47 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  36.16 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  32.11 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  37.31 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  37.31 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  35.98 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  34.77 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  37.02 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  34.63 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  36.11 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.2 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>